תוכניות מנהיגות יישובית הן תוכניות "מכוונות מקום". מטרתן ליצור קבוצות מנהיגות מקומיות הכוללות בעלי תפקידים ופעילים בעלי יכולות ומחויבות לקהילותיהם ולחברה ככלל. קבוצות אלו יפעלו על בסיס חזון מקצועי וחברתי, ויהיו מעורבות בהובלת תהליכי שינוי. כהכנה לכל תוכנית מתבצעת למידה מקדימה של היישוב, כאשר כל תוכנית מתוכננת ומותאמת ספציפית לצרכי המקום.
התוכניות נעשות בשיתוף המנהיגות היישובית, כאשר המשתתפים עוברים תהליך של מיון על ידי המרכז ונציגות היישוב. משתתפי התוכנית הינם בעלי השכלה אקדמית והכשרה מקצועית בתחומם. התוכנית מוסיפה שכבות ידע כלליות ומכוונות מקום שמטרתן להשפיע על אופן הפעלת שיקול הדעת המקצועי של המשתתפים.
משך התוכניות הינו כשנתיים. במהלכן מתנהל תהליך אישי וקבוצתי הכולל למידה מעמיקה, חשיבה ודיונים בנושאים כלליים ובנושאים הנוגעים ליישוב. תהליך הלמידה משלב תיאוריה וידע אקדמי עם פרקטיקה וידע מעשי. לצד הלמידה העיונית, מתנהל תהליך אישי, בין-אישי וקבוצתי מונחה שמטרתו לטפח מיומנויות דיאלוג ותקשורת קבוצתית.
המשתתפים בתוכניות השונות ממלאים כיום ואמורים למלא בעתיד תפקידי הנהגה חברתית ביישוב – במערכת החינוך, ביחידות חינוכיות פורמאליות ובלתי פורמאליות, במערכת הרווחה, במוסדות וארגונים, ומגוון תפקידים, ויתרמו תרומה משמעותית לקידום היישוב ורווחת תושביו.